Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ifnar1P33896 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ifnar1P33896 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ifnar1P33896 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifnar1P33896 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifnar1P33896 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifnar1P33896 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifnar1P33896 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifnar1P33896 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifnar1P33896 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifnar1P33896 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifnar1P33896 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifnar1P33896 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ifnar1P33896 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ifnar1P33896 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ifnar1P33896 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ifnar1P33896 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ifnar1P33896 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ifnar1P33896 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ifnar1P33896 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ifnar1P33896 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ifnar1P33896 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ifnar1P33896 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifnar1P33896 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifnar1P33896 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifnar1P33896 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifnar1P33896 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifnar1P33896 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifnar1P33896 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifnar1P33896 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifnar1P33896 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifnar1P33896 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifnar1P33896 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifnar1P33896 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifnar1P33896 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifnar1P33896 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifnar1P33896 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifnar1P33896 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifnar1P33896 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifnar1P33896 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifnar1P33896 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ifnar1P33896 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ifnar1P33896 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ifnar1P33896 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ifnar1P33896 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ifnar1P33896 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ifnar1P33896 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ifnar1P33896 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ifnar1P33896 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ifnar1P33896 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ifnar1P33896 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ifnar1P33896 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ifnar1P33896 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms