Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkcdP28867 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkcdP28867 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkcdP28867 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkcdP28867 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkcdP28867 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkcdP28867 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkcdP28867 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkcdP28867 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkcdP28867 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkcdP28867 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkcdP28867 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkcdP28867 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkcdP28867 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkcdP28867 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkcdP28867 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkcdP28867 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkcdP28867 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkcdP28867 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkcdP28867 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkcdP28867 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkcdP28867 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkcdP28867 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkcdP28867 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkcdP28867 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkcdP28867 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrkcdP28867 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PrkcdP28867 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrkcdP28867 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrkcdP28867 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrkcdP28867 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrkcdP28867 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
PrkcdP28867 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkcdP28867 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkcdP28867 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkcdP28867 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkcdP28867 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkcdP28867 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkcdP28867 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkcdP28867 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms