Protein–RNA interactions for Protein: P28575

Ipp, Actin-binding protein IPP, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IppP28575 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IppP28575 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IppP28575 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IppP28575 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IppP28575 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IppP28575 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IppP28575 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IppP28575 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IppP28575 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IppP28575 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IppP28575 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IppP28575 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IppP28575 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IppP28575 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IppP28575 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IppP28575 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IppP28575 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IppP28575 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IppP28575 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IppP28575 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IppP28575 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IppP28575 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IppP28575 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IppP28575 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IppP28575 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IppP28575 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IppP28575 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
IppP28575 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IppP28575 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IppP28575 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
IppP28575 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IppP28575 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IppP28575 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IppP28575 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IppP28575 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IppP28575 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IppP28575 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IppP28575 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IppP28575 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IppP28575 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IppP28575 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IppP28575 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IppP28575 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IppP28575 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IppP28575 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IppP28575 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IppP28575 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IppP28575 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IppP28575 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IppP28575 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IppP28575 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IppP28575 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IppP28575 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IppP28575 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IppP28575 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IppP28575 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IppP28575 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IppP28575 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IppP28575 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IppP28575 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IppP28575 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IppP28575 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IppP28575 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IppP28575 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IppP28575 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IppP28575 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IppP28575 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IppP28575 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IppP28575 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IppP28575 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IppP28575 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IppP28575 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IppP28575 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IppP28575 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IppP28575 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IppP28575 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IppP28575 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IppP28575 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IppP28575 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IppP28575 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IppP28575 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IppP28575 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IppP28575 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IppP28575 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IppP28575 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IppP28575 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IppP28575 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IppP28575 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IppP28575 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IppP28575 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IppP28575 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IppP28575 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IppP28575 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IppP28575 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IppP28575 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IppP28575 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IppP28575 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IppP28575 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IppP28575 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IppP28575 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms