Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms