Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms