Protein–RNA interactions for Protein: P18181

Cd48, CD48 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd48P18181 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd48P18181 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd48P18181 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd48P18181 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd48P18181 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd48P18181 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd48P18181 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd48P18181 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd48P18181 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd48P18181 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd48P18181 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd48P18181 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd48P18181 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd48P18181 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd48P18181 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd48P18181 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd48P18181 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd48P18181 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd48P18181 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd48P18181 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd48P18181 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd48P18181 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd48P18181 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd48P18181 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd48P18181 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd48P18181 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd48P18181 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd48P18181 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd48P18181 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd48P18181 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd48P18181 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd48P18181 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd48P18181 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd48P18181 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd48P18181 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd48P18181 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd48P18181 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd48P18181 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd48P18181 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd48P18181 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd48P18181 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd48P18181 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd48P18181 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd48P18181 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd48P18181 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd48P18181 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd48P18181 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd48P18181 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd48P18181 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd48P18181 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd48P18181 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd48P18181 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd48P18181 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd48P18181 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd48P18181 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd48P18181 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd48P18181 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd48P18181 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd48P18181 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd48P18181 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd48P18181 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd48P18181 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd48P18181 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd48P18181 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd48P18181 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd48P18181 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd48P18181 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd48P18181 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd48P18181 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd48P18181 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd48P18181 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd48P18181 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd48P18181 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd48P18181 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd48P18181 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd48P18181 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd48P18181 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd48P18181 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd48P18181 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd48P18181 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd48P18181 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd48P18181 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd48P18181 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd48P18181 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd48P18181 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd48P18181 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd48P18181 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd48P18181 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd48P18181 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd48P18181 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd48P18181 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd48P18181 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd48P18181 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd48P18181 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd48P18181 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd48P18181 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd48P18181 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd48P18181 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd48P18181 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd48P18181 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms