Protein–RNA interactions for Protein: P12850

Cxcl1, Growth-regulated alpha protein, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl1P12850 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxcl1P12850 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxcl1P12850 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxcl1P12850 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxcl1P12850 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxcl1P12850 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxcl1P12850 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxcl1P12850 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxcl1P12850 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxcl1P12850 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxcl1P12850 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxcl1P12850 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxcl1P12850 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxcl1P12850 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxcl1P12850 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxcl1P12850 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxcl1P12850 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxcl1P12850 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxcl1P12850 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxcl1P12850 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxcl1P12850 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxcl1P12850 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxcl1P12850 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxcl1P12850 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxcl1P12850 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxcl1P12850 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxcl1P12850 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxcl1P12850 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxcl1P12850 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxcl1P12850 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcl1P12850 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcl1P12850 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcl1P12850 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcl1P12850 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcl1P12850 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcl1P12850 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcl1P12850 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcl1P12850 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcl1P12850 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcl1P12850 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcl1P12850 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcl1P12850 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcl1P12850 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcl1P12850 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcl1P12850 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcl1P12850 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcl1P12850 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcl1P12850 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms