Protein–RNA interactions for Protein: P01788

Ig heavy chain V region H8, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01788 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01788 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01788 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01788 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01788 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01788 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01788 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01788 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01788 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01788 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01788 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01788 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01788 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01788 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01788 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01788 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01788 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01788 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01788 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01788 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01788 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01788 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01788 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01788 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01788 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01788 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01788 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01788 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01788 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01788 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01788 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01788 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01788 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01788 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01788 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01788 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01788 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01788 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01788 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01788 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01788 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01788 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01788 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01788 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01788 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01788 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01788 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01788 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01788 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01788 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01788 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01788 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01788 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01788 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01788 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01788 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01788 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01788 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01788 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01788 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01788 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01788 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01788 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01788 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01788 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01788 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01788 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01788 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01788 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01788 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01788 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01788 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01788 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01788 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01788 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01788 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01788 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01788 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01788 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01788 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01788 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P01788 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P01788 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01788 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01788 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01788 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01788 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01788 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01788 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01788 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01788 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01788 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01788 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01788 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01788 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01788 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01788 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01788 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01788 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01788 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms