Protein–RNA interactions for Protein: P01652

Ig kappa chain V-V region J606, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01652 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01652 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01652 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01652 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
P01652 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01652 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
P01652 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01652 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01652 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01652 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01652 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01652 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01652 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.3■■□□□ 1
P01652 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01652 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01652 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
P01652 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01652 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01652 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01652 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01652 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01652 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01652 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01652 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01652 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01652 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01652 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01652 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01652 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
P01652 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01652 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
P01652 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
P01652 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01652 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01652 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.28■■□□□ 1
P01652 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01652 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
P01652 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01652 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01652 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01652 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01652 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01652 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P01652 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.27■■□□□ 1
P01652 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P01652 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
P01652 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
P01652 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01652 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01652 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01652 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01652 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01652 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01652 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01652 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01652 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01652 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01652 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01652 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01652 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01652 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01652 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
P01652 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
P01652 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01652 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
P01652 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01652 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01652 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
P01652 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01652 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01652 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01652 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01652 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01652 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01652 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01652 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01652 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01652 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01652 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01652 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01652 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01652 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01652 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01652 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01652 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01652 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01652 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01652 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01652 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01652 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01652 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01652 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01652 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01652 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01652 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01652 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01652 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
P01652 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P01652 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P01652 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms