Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hcn2O88703 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hcn2O88703 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Hcn2O88703 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hcn2O88703 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hcn2O88703 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Hcn2O88703 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Hcn2O88703 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms