Protein–RNA interactions for Protein: O70218

Hmx1, Homeobox protein HMX1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx1O70218 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hmx1O70218 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hmx1O70218 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hmx1O70218 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hmx1O70218 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hmx1O70218 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hmx1O70218 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hmx1O70218 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hmx1O70218 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hmx1O70218 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hmx1O70218 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Hmx1O70218 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hmx1O70218 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hmx1O70218 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hmx1O70218 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hmx1O70218 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hmx1O70218 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hmx1O70218 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hmx1O70218 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hmx1O70218 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hmx1O70218 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmx1O70218 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmx1O70218 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmx1O70218 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmx1O70218 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hmx1O70218 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hmx1O70218 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hmx1O70218 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hmx1O70218 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Hmx1O70218 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hmx1O70218 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hmx1O70218 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hmx1O70218 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hmx1O70218 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hmx1O70218 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hmx1O70218 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hmx1O70218 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hmx1O70218 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmx1O70218 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmx1O70218 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmx1O70218 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmx1O70218 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmx1O70218 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmx1O70218 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmx1O70218 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hmx1O70218 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hmx1O70218 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hmx1O70218 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hmx1O70218 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hmx1O70218 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hmx1O70218 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hmx1O70218 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hmx1O70218 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmx1O70218 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmx1O70218 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmx1O70218 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmx1O70218 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmx1O70218 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmx1O70218 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmx1O70218 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmx1O70218 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmx1O70218 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hmx1O70218 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hmx1O70218 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Hmx1O70218 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hmx1O70218 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hmx1O70218 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hmx1O70218 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hmx1O70218 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hmx1O70218 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hmx1O70218 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hmx1O70218 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hmx1O70218 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hmx1O70218 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hmx1O70218 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hmx1O70218 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Hmx1O70218 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hmx1O70218 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hmx1O70218 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Hmx1O70218 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hmx1O70218 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hmx1O70218 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hmx1O70218 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hmx1O70218 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hmx1O70218 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmx1O70218 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmx1O70218 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmx1O70218 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmx1O70218 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmx1O70218 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmx1O70218 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmx1O70218 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmx1O70218 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmx1O70218 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmx1O70218 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmx1O70218 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmx1O70218 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmx1O70218 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmx1O70218 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmx1O70218 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms