Protein–RNA interactions for Protein: O55127

Cyp26a1, Cytochrome P450 26A1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26a1O55127 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyp26a1O55127 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyp26a1O55127 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyp26a1O55127 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyp26a1O55127 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyp26a1O55127 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyp26a1O55127 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyp26a1O55127 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyp26a1O55127 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyp26a1O55127 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyp26a1O55127 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyp26a1O55127 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyp26a1O55127 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyp26a1O55127 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyp26a1O55127 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyp26a1O55127 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyp26a1O55127 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyp26a1O55127 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyp26a1O55127 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyp26a1O55127 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyp26a1O55127 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyp26a1O55127 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyp26a1O55127 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyp26a1O55127 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyp26a1O55127 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyp26a1O55127 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyp26a1O55127 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyp26a1O55127 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyp26a1O55127 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyp26a1O55127 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyp26a1O55127 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyp26a1O55127 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cyp26a1O55127 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cyp26a1O55127 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cyp26a1O55127 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cyp26a1O55127 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cyp26a1O55127 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyp26a1O55127 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyp26a1O55127 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyp26a1O55127 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyp26a1O55127 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyp26a1O55127 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyp26a1O55127 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyp26a1O55127 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyp26a1O55127 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyp26a1O55127 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyp26a1O55127 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyp26a1O55127 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cyp26a1O55127 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cyp26a1O55127 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cyp26a1O55127 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cyp26a1O55127 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyp26a1O55127 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyp26a1O55127 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyp26a1O55127 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyp26a1O55127 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyp26a1O55127 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyp26a1O55127 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyp26a1O55127 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cyp26a1O55127 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cyp26a1O55127 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cyp26a1O55127 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cyp26a1O55127 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms