Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nipsnap2O55126 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nipsnap2O55126 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nipsnap2O55126 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nipsnap2O55126 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nipsnap2O55126 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nipsnap2O55126 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nipsnap2O55126 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nipsnap2O55126 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nipsnap2O55126 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nipsnap2O55126 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Nipsnap2O55126 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nipsnap2O55126 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nipsnap2O55126 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nipsnap2O55126 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nipsnap2O55126 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nipsnap2O55126 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nipsnap2O55126 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nipsnap2O55126 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nipsnap2O55126 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nipsnap2O55126 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nipsnap2O55126 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nipsnap2O55126 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nipsnap2O55126 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Nipsnap2O55126 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nipsnap2O55126 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nipsnap2O55126 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nipsnap2O55126 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nipsnap2O55126 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nipsnap2O55126 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nipsnap2O55126 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nipsnap2O55126 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nipsnap2O55126 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nipsnap2O55126 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nipsnap2O55126 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nipsnap2O55126 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nipsnap2O55126 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Nipsnap2O55126 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nipsnap2O55126 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nipsnap2O55126 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nipsnap2O55126 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nipsnap2O55126 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Nipsnap2O55126 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nipsnap2O55126 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nipsnap2O55126 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nipsnap2O55126 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Nipsnap2O55126 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nipsnap2O55126 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nipsnap2O55126 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nipsnap2O55126 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nipsnap2O55126 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nipsnap2O55126 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nipsnap2O55126 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nipsnap2O55126 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nipsnap2O55126 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Nipsnap2O55126 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nipsnap2O55126 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nipsnap2O55126 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nipsnap2O55126 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nipsnap2O55126 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nipsnap2O55126 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nipsnap2O55126 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nipsnap2O55126 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nipsnap2O55126 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nipsnap2O55126 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nipsnap2O55126 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nipsnap2O55126 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nipsnap2O55126 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nipsnap2O55126 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nipsnap2O55126 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nipsnap2O55126 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nipsnap2O55126 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nipsnap2O55126 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nipsnap2O55126 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nipsnap2O55126 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Nipsnap2O55126 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nipsnap2O55126 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nipsnap2O55126 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nipsnap2O55126 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nipsnap2O55126 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Nipsnap2O55126 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nipsnap2O55126 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms