Protein–RNA interactions for Protein: O55033

Nck2, Cytoplasmic protein NCK2, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nck2O55033 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nck2O55033 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nck2O55033 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nck2O55033 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Nck2O55033 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nck2O55033 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nck2O55033 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nck2O55033 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nck2O55033 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nck2O55033 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nck2O55033 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nck2O55033 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Nck2O55033 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nck2O55033 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nck2O55033 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nck2O55033 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nck2O55033 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nck2O55033 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Nck2O55033 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nck2O55033 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nck2O55033 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nck2O55033 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nck2O55033 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nck2O55033 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nck2O55033 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nck2O55033 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nck2O55033 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nck2O55033 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nck2O55033 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nck2O55033 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nck2O55033 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nck2O55033 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nck2O55033 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nck2O55033 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nck2O55033 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nck2O55033 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nck2O55033 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nck2O55033 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nck2O55033 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nck2O55033 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nck2O55033 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nck2O55033 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nck2O55033 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nck2O55033 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nck2O55033 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Nck2O55033 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Nck2O55033 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Nck2O55033 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nck2O55033 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nck2O55033 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nck2O55033 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nck2O55033 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nck2O55033 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nck2O55033 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nck2O55033 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nck2O55033 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nck2O55033 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nck2O55033 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nck2O55033 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nck2O55033 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nck2O55033 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Nck2O55033 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nck2O55033 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nck2O55033 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Nck2O55033 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nck2O55033 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nck2O55033 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nck2O55033 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Nck2O55033 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nck2O55033 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Nck2O55033 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nck2O55033 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nck2O55033 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nck2O55033 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nck2O55033 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nck2O55033 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nck2O55033 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nck2O55033 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nck2O55033 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nck2O55033 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nck2O55033 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nck2O55033 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nck2O55033 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nck2O55033 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nck2O55033 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nck2O55033 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nck2O55033 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nck2O55033 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nck2O55033 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nck2O55033 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Nck2O55033 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nck2O55033 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nck2O55033 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nck2O55033 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nck2O55033 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nck2O55033 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nck2O55033 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nck2O55033 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nck2O55033 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Nck2O55033 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms