Protein–RNA interactions for Protein: O54957

Lat, Linker for activation of T-cells family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LatO54957 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LatO54957 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LatO54957 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LatO54957 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LatO54957 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LatO54957 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LatO54957 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LatO54957 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LatO54957 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
LatO54957 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LatO54957 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LatO54957 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LatO54957 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LatO54957 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LatO54957 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LatO54957 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LatO54957 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LatO54957 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LatO54957 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LatO54957 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LatO54957 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LatO54957 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LatO54957 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LatO54957 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LatO54957 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LatO54957 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LatO54957 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LatO54957 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LatO54957 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LatO54957 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LatO54957 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LatO54957 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LatO54957 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LatO54957 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LatO54957 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LatO54957 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LatO54957 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LatO54957 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LatO54957 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LatO54957 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LatO54957 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LatO54957 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LatO54957 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LatO54957 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LatO54957 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LatO54957 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LatO54957 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LatO54957 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LatO54957 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LatO54957 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LatO54957 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LatO54957 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LatO54957 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LatO54957 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LatO54957 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LatO54957 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LatO54957 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LatO54957 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LatO54957 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LatO54957 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LatO54957 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LatO54957 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LatO54957 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LatO54957 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LatO54957 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LatO54957 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LatO54957 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LatO54957 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LatO54957 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LatO54957 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LatO54957 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LatO54957 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LatO54957 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LatO54957 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LatO54957 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LatO54957 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LatO54957 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LatO54957 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
LatO54957 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LatO54957 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LatO54957 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LatO54957 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LatO54957 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LatO54957 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LatO54957 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
LatO54957 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
LatO54957 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LatO54957 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LatO54957 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LatO54957 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LatO54957 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LatO54957 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LatO54957 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LatO54957 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
LatO54957 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LatO54957 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LatO54957 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LatO54957 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LatO54957 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LatO54957 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms