Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh2d1bO35324 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh2d1bO35324 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh2d1bO35324 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh2d1bO35324 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh2d1bO35324 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh2d1bO35324 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh2d1bO35324 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh2d1bO35324 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh2d1bO35324 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh2d1bO35324 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh2d1bO35324 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh2d1bO35324 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh2d1bO35324 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh2d1bO35324 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh2d1bO35324 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh2d1bO35324 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh2d1bO35324 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh2d1bO35324 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh2d1bO35324 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh2d1bO35324 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh2d1bO35324 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh2d1bO35324 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh2d1bO35324 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh2d1bO35324 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sh2d1bO35324 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sh2d1bO35324 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh2d1bO35324 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh2d1bO35324 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh2d1bO35324 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh2d1bO35324 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh2d1bO35324 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh2d1bO35324 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh2d1bO35324 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh2d1bO35324 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh2d1bO35324 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh2d1bO35324 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh2d1bO35324 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh2d1bO35324 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh2d1bO35324 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh2d1bO35324 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh2d1bO35324 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh2d1bO35324 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh2d1bO35324 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh2d1bO35324 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh2d1bO35324 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh2d1bO35324 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh2d1bO35324 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh2d1bO35324 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh2d1bO35324 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh2d1bO35324 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh2d1bO35324 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh2d1bO35324 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh2d1bO35324 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh2d1bO35324 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh2d1bO35324 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh2d1bO35324 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh2d1bO35324 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh2d1bO35324 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh2d1bO35324 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh2d1bO35324 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh2d1bO35324 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh2d1bO35324 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh2d1bO35324 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh2d1bO35324 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh2d1bO35324 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh2d1bO35324 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh2d1bO35324 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh2d1bO35324 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh2d1bO35324 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh2d1bO35324 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh2d1bO35324 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sh2d1bO35324 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sh2d1bO35324 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms