Protein–RNA interactions for Protein: L7N1Z3

Vmn1r80, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r80L7N1Z3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r80L7N1Z3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r80L7N1Z3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms