Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm2035J3QP87 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm2035J3QP87 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm2035J3QP87 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm2035J3QP87 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm2035J3QP87 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm2035J3QP87 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm2035J3QP87 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm2035J3QP87 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm2035J3QP87 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm2035J3QP87 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm2035J3QP87 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm2035J3QP87 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm2035J3QP87 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm2035J3QP87 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm2035J3QP87 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm2035J3QP87 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm2035J3QP87 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm2035J3QP87 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm2035J3QP87 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm2035J3QP87 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm2035J3QP87 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm2035J3QP87 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm2035J3QP87 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm2035J3QP87 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm2035J3QP87 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm2035J3QP87 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm2035J3QP87 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm2035J3QP87 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm2035J3QP87 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm2035J3QP87 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm2035J3QP87 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm2035J3QP87 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm2035J3QP87 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm2035J3QP87 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm2035J3QP87 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm2035J3QP87 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm2035J3QP87 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm2035J3QP87 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm2035J3QP87 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm2035J3QP87 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm2035J3QP87 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm2035J3QP87 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm2035J3QP87 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm2035J3QP87 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm2035J3QP87 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm2035J3QP87 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm2035J3QP87 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm2035J3QP87 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm2035J3QP87 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm2035J3QP87 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm2035J3QP87 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm2035J3QP87 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm2035J3QP87 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm2035J3QP87 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm2035J3QP87 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm2035J3QP87 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm2035J3QP87 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm2035J3QP87 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm2035J3QP87 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm2035J3QP87 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm2035J3QP87 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm2035J3QP87 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms