Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Smim18J3QNP2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim18J3QNP2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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