Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21060J3KMU4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21060J3KMU4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21060J3KMU4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21060J3KMU4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21060J3KMU4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21060J3KMU4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21060J3KMU4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21060J3KMU4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21060J3KMU4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21060J3KMU4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21060J3KMU4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21060J3KMU4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21060J3KMU4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21060J3KMU4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21060J3KMU4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21060J3KMU4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21060J3KMU4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21060J3KMU4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21060J3KMU4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21060J3KMU4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gm21060J3KMU4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21060J3KMU4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21060J3KMU4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21060J3KMU4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21060J3KMU4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21060J3KMU4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21060J3KMU4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21060J3KMU4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21060J3KMU4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21060J3KMU4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21060J3KMU4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21060J3KMU4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms