Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sh3tc1G3X9F6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sh3tc1G3X9F6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sh3tc1G3X9F6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sh3tc1G3X9F6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sh3tc1G3X9F6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sh3tc1G3X9F6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sh3tc1G3X9F6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sh3tc1G3X9F6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sh3tc1G3X9F6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sh3tc1G3X9F6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sh3tc1G3X9F6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sh3tc1G3X9F6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sh3tc1G3X9F6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sh3tc1G3X9F6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sh3tc1G3X9F6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sh3tc1G3X9F6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sh3tc1G3X9F6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sh3tc1G3X9F6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sh3tc1G3X9F6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sh3tc1G3X9F6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sh3tc1G3X9F6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sh3tc1G3X9F6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sh3tc1G3X9F6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sh3tc1G3X9F6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Sh3tc1G3X9F6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sh3tc1G3X9F6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sh3tc1G3X9F6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sh3tc1G3X9F6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sh3tc1G3X9F6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sh3tc1G3X9F6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sh3tc1G3X9F6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sh3tc1G3X9F6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sh3tc1G3X9F6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sh3tc1G3X9F6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Sh3tc1G3X9F6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sh3tc1G3X9F6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sh3tc1G3X9F6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sh3tc1G3X9F6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sh3tc1G3X9F6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sh3tc1G3X9F6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sh3tc1G3X9F6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sh3tc1G3X9F6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sh3tc1G3X9F6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sh3tc1G3X9F6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sh3tc1G3X9F6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sh3tc1G3X9F6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sh3tc1G3X9F6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Sh3tc1G3X9F6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sh3tc1G3X9F6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Sh3tc1G3X9F6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sh3tc1G3X9F6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sh3tc1G3X9F6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sh3tc1G3X9F6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms