Protein–RNA interactions for Protein: G3X964

2610008E11Rik, RIKEN cDNA 2610008E11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610008E11RikG3X964 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
2610008E11RikG3X964 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
2610008E11RikG3X964 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
2610008E11RikG3X964 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
2610008E11RikG3X964 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
2610008E11RikG3X964 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
2610008E11RikG3X964 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
2610008E11RikG3X964 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
2610008E11RikG3X964 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
2610008E11RikG3X964 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
2610008E11RikG3X964 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
2610008E11RikG3X964 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
2610008E11RikG3X964 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
2610008E11RikG3X964 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
2610008E11RikG3X964 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
2610008E11RikG3X964 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
2610008E11RikG3X964 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
2610008E11RikG3X964 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
2610008E11RikG3X964 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
2610008E11RikG3X964 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
2610008E11RikG3X964 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
2610008E11RikG3X964 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
2610008E11RikG3X964 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
2610008E11RikG3X964 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
2610008E11RikG3X964 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
2610008E11RikG3X964 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
2610008E11RikG3X964 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
2610008E11RikG3X964 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
2610008E11RikG3X964 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
2610008E11RikG3X964 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
2610008E11RikG3X964 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
2610008E11RikG3X964 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
2610008E11RikG3X964 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
2610008E11RikG3X964 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
2610008E11RikG3X964 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
2610008E11RikG3X964 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
2610008E11RikG3X964 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
2610008E11RikG3X964 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
2610008E11RikG3X964 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
2610008E11RikG3X964 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
2610008E11RikG3X964 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
2610008E11RikG3X964 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
2610008E11RikG3X964 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
2610008E11RikG3X964 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
2610008E11RikG3X964 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
2610008E11RikG3X964 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
2610008E11RikG3X964 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
2610008E11RikG3X964 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
2610008E11RikG3X964 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
2610008E11RikG3X964 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
2610008E11RikG3X964 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
2610008E11RikG3X964 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
2610008E11RikG3X964 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
2610008E11RikG3X964 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
2610008E11RikG3X964 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
2610008E11RikG3X964 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
2610008E11RikG3X964 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
2610008E11RikG3X964 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
2610008E11RikG3X964 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
2610008E11RikG3X964 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
2610008E11RikG3X964 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
2610008E11RikG3X964 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
2610008E11RikG3X964 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
2610008E11RikG3X964 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
2610008E11RikG3X964 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
2610008E11RikG3X964 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
2610008E11RikG3X964 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
2610008E11RikG3X964 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
2610008E11RikG3X964 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
2610008E11RikG3X964 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
2610008E11RikG3X964 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
2610008E11RikG3X964 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
2610008E11RikG3X964 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
2610008E11RikG3X964 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
2610008E11RikG3X964 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
2610008E11RikG3X964 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
2610008E11RikG3X964 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
2610008E11RikG3X964 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
2610008E11RikG3X964 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
2610008E11RikG3X964 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
2610008E11RikG3X964 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
2610008E11RikG3X964 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
2610008E11RikG3X964 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
2610008E11RikG3X964 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
2610008E11RikG3X964 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
2610008E11RikG3X964 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
2610008E11RikG3X964 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
2610008E11RikG3X964 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
2610008E11RikG3X964 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
2610008E11RikG3X964 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
2610008E11RikG3X964 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
2610008E11RikG3X964 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
2610008E11RikG3X964 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
2610008E11RikG3X964 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
2610008E11RikG3X964 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
2610008E11RikG3X964 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
2610008E11RikG3X964 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
2610008E11RikG3X964 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
2610008E11RikG3X964 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
2610008E11RikG3X964 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms