Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms