Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syngap1F6SEU4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syngap1F6SEU4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syngap1F6SEU4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syngap1F6SEU4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syngap1F6SEU4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syngap1F6SEU4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syngap1F6SEU4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syngap1F6SEU4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syngap1F6SEU4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Syngap1F6SEU4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syngap1F6SEU4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syngap1F6SEU4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syngap1F6SEU4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Syngap1F6SEU4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syngap1F6SEU4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syngap1F6SEU4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Syngap1F6SEU4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Syngap1F6SEU4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Syngap1F6SEU4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Syngap1F6SEU4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Syngap1F6SEU4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Syngap1F6SEU4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Syngap1F6SEU4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Syngap1F6SEU4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syngap1F6SEU4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syngap1F6SEU4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syngap1F6SEU4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syngap1F6SEU4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Syngap1F6SEU4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syngap1F6SEU4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syngap1F6SEU4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Syngap1F6SEU4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syngap1F6SEU4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Syngap1F6SEU4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syngap1F6SEU4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syngap1F6SEU4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syngap1F6SEU4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Syngap1F6SEU4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syngap1F6SEU4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syngap1F6SEU4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syngap1F6SEU4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syngap1F6SEU4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syngap1F6SEU4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syngap1F6SEU4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syngap1F6SEU4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syngap1F6SEU4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syngap1F6SEU4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Syngap1F6SEU4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Syngap1F6SEU4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Syngap1F6SEU4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syngap1F6SEU4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syngap1F6SEU4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syngap1F6SEU4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syngap1F6SEU4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syngap1F6SEU4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syngap1F6SEU4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syngap1F6SEU4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Syngap1F6SEU4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syngap1F6SEU4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syngap1F6SEU4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syngap1F6SEU4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syngap1F6SEU4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syngap1F6SEU4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syngap1F6SEU4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syngap1F6SEU4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syngap1F6SEU4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syngap1F6SEU4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syngap1F6SEU4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syngap1F6SEU4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syngap1F6SEU4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Syngap1F6SEU4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Syngap1F6SEU4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Syngap1F6SEU4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Syngap1F6SEU4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Syngap1F6SEU4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Syngap1F6SEU4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Syngap1F6SEU4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Syngap1F6SEU4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Syngap1F6SEU4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syngap1F6SEU4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syngap1F6SEU4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syngap1F6SEU4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syngap1F6SEU4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syngap1F6SEU4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syngap1F6SEU4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syngap1F6SEU4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syngap1F6SEU4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syngap1F6SEU4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syngap1F6SEU4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syngap1F6SEU4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syngap1F6SEU4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syngap1F6SEU4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Syngap1F6SEU4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syngap1F6SEU4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syngap1F6SEU4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syngap1F6SEU4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Syngap1F6SEU4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syngap1F6SEU4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syngap1F6SEU4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms