Protein–RNA interactions for Protein: F6Q785

Gm29094, Predicted gene 29094 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29094F6Q785 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm29094F6Q785 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm29094F6Q785 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm29094F6Q785 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm29094F6Q785 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm29094F6Q785 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm29094F6Q785 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm29094F6Q785 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm29094F6Q785 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm29094F6Q785 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm29094F6Q785 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gm29094F6Q785 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm29094F6Q785 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm29094F6Q785 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm29094F6Q785 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm29094F6Q785 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm29094F6Q785 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm29094F6Q785 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm29094F6Q785 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm29094F6Q785 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm29094F6Q785 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm29094F6Q785 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm29094F6Q785 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm29094F6Q785 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm29094F6Q785 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm29094F6Q785 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm29094F6Q785 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm29094F6Q785 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm29094F6Q785 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm29094F6Q785 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm29094F6Q785 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm29094F6Q785 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm29094F6Q785 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm29094F6Q785 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm29094F6Q785 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm29094F6Q785 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm29094F6Q785 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm29094F6Q785 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm29094F6Q785 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm29094F6Q785 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm29094F6Q785 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm29094F6Q785 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm29094F6Q785 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm29094F6Q785 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm29094F6Q785 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm29094F6Q785 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm29094F6Q785 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm29094F6Q785 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm29094F6Q785 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm29094F6Q785 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm29094F6Q785 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm29094F6Q785 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm29094F6Q785 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm29094F6Q785 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm29094F6Q785 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm29094F6Q785 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gm29094F6Q785 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms