Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc74aE9Q9U8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc74aE9Q9U8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc74aE9Q9U8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc74aE9Q9U8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc74aE9Q9U8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc74aE9Q9U8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc74aE9Q9U8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc74aE9Q9U8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc74aE9Q9U8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc74aE9Q9U8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc74aE9Q9U8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc74aE9Q9U8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc74aE9Q9U8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc74aE9Q9U8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc74aE9Q9U8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc74aE9Q9U8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc74aE9Q9U8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc74aE9Q9U8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc74aE9Q9U8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc74aE9Q9U8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc74aE9Q9U8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc74aE9Q9U8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc74aE9Q9U8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc74aE9Q9U8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc74aE9Q9U8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc74aE9Q9U8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc74aE9Q9U8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc74aE9Q9U8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc74aE9Q9U8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc74aE9Q9U8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc74aE9Q9U8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc74aE9Q9U8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc74aE9Q9U8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc74aE9Q9U8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc74aE9Q9U8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc74aE9Q9U8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc74aE9Q9U8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc74aE9Q9U8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc74aE9Q9U8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc74aE9Q9U8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc74aE9Q9U8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc74aE9Q9U8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc74aE9Q9U8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc74aE9Q9U8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc74aE9Q9U8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc74aE9Q9U8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc74aE9Q9U8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc74aE9Q9U8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc74aE9Q9U8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc74aE9Q9U8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc74aE9Q9U8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc74aE9Q9U8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc74aE9Q9U8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc74aE9Q9U8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc74aE9Q9U8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc74aE9Q9U8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc74aE9Q9U8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc74aE9Q9U8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc74aE9Q9U8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc74aE9Q9U8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc74aE9Q9U8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc74aE9Q9U8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc74aE9Q9U8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc74aE9Q9U8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc74aE9Q9U8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc74aE9Q9U8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc74aE9Q9U8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc74aE9Q9U8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc74aE9Q9U8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc74aE9Q9U8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc74aE9Q9U8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc74aE9Q9U8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc74aE9Q9U8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc74aE9Q9U8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc74aE9Q9U8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc74aE9Q9U8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc74aE9Q9U8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc74aE9Q9U8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc74aE9Q9U8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc74aE9Q9U8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc74aE9Q9U8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc74aE9Q9U8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc74aE9Q9U8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc74aE9Q9U8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc74aE9Q9U8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc74aE9Q9U8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc74aE9Q9U8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms