Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp31E9Q6Y8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp31E9Q6Y8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp31E9Q6Y8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp31E9Q6Y8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp31E9Q6Y8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp31E9Q6Y8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp31E9Q6Y8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp31E9Q6Y8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp31E9Q6Y8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp31E9Q6Y8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp31E9Q6Y8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp31E9Q6Y8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp31E9Q6Y8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp31E9Q6Y8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp31E9Q6Y8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp31E9Q6Y8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp31E9Q6Y8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp31E9Q6Y8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp31E9Q6Y8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp31E9Q6Y8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp31E9Q6Y8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp31E9Q6Y8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp31E9Q6Y8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp31E9Q6Y8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp31E9Q6Y8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp31E9Q6Y8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp31E9Q6Y8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp31E9Q6Y8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp31E9Q6Y8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp31E9Q6Y8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp31E9Q6Y8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp31E9Q6Y8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp31E9Q6Y8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp31E9Q6Y8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp31E9Q6Y8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms