Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ8

E430018J23Rik, RIKEN cDNA E430018J23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E430018J23RikE9PZQ8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
E430018J23RikE9PZQ8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
E430018J23RikE9PZQ8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
E430018J23RikE9PZQ8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
E430018J23RikE9PZQ8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E430018J23RikE9PZQ8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E430018J23RikE9PZQ8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E430018J23RikE9PZQ8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E430018J23RikE9PZQ8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E430018J23RikE9PZQ8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E430018J23RikE9PZQ8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E430018J23RikE9PZQ8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E430018J23RikE9PZQ8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E430018J23RikE9PZQ8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E430018J23RikE9PZQ8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E430018J23RikE9PZQ8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E430018J23RikE9PZQ8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E430018J23RikE9PZQ8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E430018J23RikE9PZQ8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E430018J23RikE9PZQ8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E430018J23RikE9PZQ8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E430018J23RikE9PZQ8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E430018J23RikE9PZQ8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E430018J23RikE9PZQ8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E430018J23RikE9PZQ8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E430018J23RikE9PZQ8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E430018J23RikE9PZQ8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E430018J23RikE9PZQ8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E430018J23RikE9PZQ8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E430018J23RikE9PZQ8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E430018J23RikE9PZQ8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E430018J23RikE9PZQ8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E430018J23RikE9PZQ8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E430018J23RikE9PZQ8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E430018J23RikE9PZQ8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E430018J23RikE9PZQ8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E430018J23RikE9PZQ8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E430018J23RikE9PZQ8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E430018J23RikE9PZQ8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E430018J23RikE9PZQ8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E430018J23RikE9PZQ8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E430018J23RikE9PZQ8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E430018J23RikE9PZQ8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E430018J23RikE9PZQ8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E430018J23RikE9PZQ8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E430018J23RikE9PZQ8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E430018J23RikE9PZQ8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E430018J23RikE9PZQ8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms