Protein–RNA interactions for Protein: E9PY46

Ift140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift140E9PY46 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ift140E9PY46 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ift140E9PY46 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ift140E9PY46 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ift140E9PY46 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ift140E9PY46 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ift140E9PY46 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ift140E9PY46 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Ift140E9PY46 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ift140E9PY46 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ift140E9PY46 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ift140E9PY46 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Ift140E9PY46 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ift140E9PY46 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ift140E9PY46 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ift140E9PY46 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Ift140E9PY46 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
Ift140E9PY46 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Ift140E9PY46 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Ift140E9PY46 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Ift140E9PY46 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Ift140E9PY46 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Ift140E9PY46 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Ift140E9PY46 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Ift140E9PY46 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Ift140E9PY46 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Ift140E9PY46 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Ift140E9PY46 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ift140E9PY46 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ift140E9PY46 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ift140E9PY46 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ift140E9PY46 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ift140E9PY46 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Ift140E9PY46 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ift140E9PY46 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ift140E9PY46 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ift140E9PY46 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ift140E9PY46 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ift140E9PY46 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ift140E9PY46 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ift140E9PY46 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ift140E9PY46 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ift140E9PY46 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ift140E9PY46 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ift140E9PY46 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ift140E9PY46 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ift140E9PY46 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ift140E9PY46 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ift140E9PY46 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ift140E9PY46 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ift140E9PY46 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ift140E9PY46 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ift140E9PY46 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Ift140E9PY46 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ift140E9PY46 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ift140E9PY46 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ift140E9PY46 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ift140E9PY46 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ift140E9PY46 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ift140E9PY46 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ift140E9PY46 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ift140E9PY46 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Ift140E9PY46 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ift140E9PY46 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ift140E9PY46 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ift140E9PY46 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Ift140E9PY46 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ift140E9PY46 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ift140E9PY46 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ift140E9PY46 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ift140E9PY46 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ift140E9PY46 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ift140E9PY46 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Ift140E9PY46 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ift140E9PY46 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ift140E9PY46 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ift140E9PY46 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ift140E9PY46 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ift140E9PY46 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Ift140E9PY46 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ift140E9PY46 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ift140E9PY46 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ift140E9PY46 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ift140E9PY46 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ift140E9PY46 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Ift140E9PY46 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ift140E9PY46 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ift140E9PY46 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ift140E9PY46 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Ift140E9PY46 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ift140E9PY46 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ift140E9PY46 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ift140E9PY46 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ift140E9PY46 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ift140E9PY46 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ift140E9PY46 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Ift140E9PY46 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ift140E9PY46 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ift140E9PY46 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ift140E9PY46 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms