Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kpna7C0LLJ0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kpna7C0LLJ0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kpna7C0LLJ0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Kpna7C0LLJ0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kpna7C0LLJ0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kpna7C0LLJ0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kpna7C0LLJ0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kpna7C0LLJ0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kpna7C0LLJ0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kpna7C0LLJ0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kpna7C0LLJ0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kpna7C0LLJ0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kpna7C0LLJ0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kpna7C0LLJ0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kpna7C0LLJ0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kpna7C0LLJ0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kpna7C0LLJ0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kpna7C0LLJ0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kpna7C0LLJ0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kpna7C0LLJ0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kpna7C0LLJ0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Kpna7C0LLJ0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kpna7C0LLJ0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kpna7C0LLJ0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kpna7C0LLJ0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kpna7C0LLJ0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kpna7C0LLJ0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kpna7C0LLJ0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kpna7C0LLJ0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kpna7C0LLJ0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kpna7C0LLJ0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kpna7C0LLJ0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kpna7C0LLJ0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kpna7C0LLJ0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kpna7C0LLJ0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kpna7C0LLJ0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kpna7C0LLJ0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kpna7C0LLJ0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kpna7C0LLJ0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kpna7C0LLJ0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kpna7C0LLJ0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kpna7C0LLJ0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kpna7C0LLJ0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kpna7C0LLJ0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kpna7C0LLJ0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kpna7C0LLJ0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kpna7C0LLJ0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kpna7C0LLJ0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kpna7C0LLJ0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kpna7C0LLJ0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Kpna7C0LLJ0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kpna7C0LLJ0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Kpna7C0LLJ0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kpna7C0LLJ0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kpna7C0LLJ0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kpna7C0LLJ0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kpna7C0LLJ0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kpna7C0LLJ0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kpna7C0LLJ0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kpna7C0LLJ0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kpna7C0LLJ0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kpna7C0LLJ0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kpna7C0LLJ0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kpna7C0LLJ0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kpna7C0LLJ0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kpna7C0LLJ0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kpna7C0LLJ0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kpna7C0LLJ0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kpna7C0LLJ0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kpna7C0LLJ0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kpna7C0LLJ0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kpna7C0LLJ0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kpna7C0LLJ0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kpna7C0LLJ0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kpna7C0LLJ0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kpna7C0LLJ0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Kpna7C0LLJ0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kpna7C0LLJ0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kpna7C0LLJ0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kpna7C0LLJ0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kpna7C0LLJ0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kpna7C0LLJ0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kpna7C0LLJ0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kpna7C0LLJ0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kpna7C0LLJ0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kpna7C0LLJ0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kpna7C0LLJ0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kpna7C0LLJ0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kpna7C0LLJ0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kpna7C0LLJ0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kpna7C0LLJ0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kpna7C0LLJ0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kpna7C0LLJ0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kpna7C0LLJ0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kpna7C0LLJ0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kpna7C0LLJ0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kpna7C0LLJ0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kpna7C0LLJ0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kpna7C0LLJ0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms