Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AU015836B2RUM3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
AU015836B2RUM3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AU015836B2RUM3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AU015836B2RUM3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AU015836B2RUM3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AU015836B2RUM3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AU015836B2RUM3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
AU015836B2RUM3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AU015836B2RUM3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AU015836B2RUM3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AU015836B2RUM3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AU015836B2RUM3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AU015836B2RUM3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
AU015836B2RUM3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AU015836B2RUM3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AU015836B2RUM3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AU015836B2RUM3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AU015836B2RUM3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AU015836B2RUM3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AU015836B2RUM3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
AU015836B2RUM3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AU015836B2RUM3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AU015836B2RUM3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AU015836B2RUM3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AU015836B2RUM3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AU015836B2RUM3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AU015836B2RUM3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AU015836B2RUM3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AU015836B2RUM3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
AU015836B2RUM3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AU015836B2RUM3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AU015836B2RUM3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AU015836B2RUM3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AU015836B2RUM3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AU015836B2RUM3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AU015836B2RUM3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
AU015836B2RUM3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AU015836B2RUM3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AU015836B2RUM3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AU015836B2RUM3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AU015836B2RUM3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AU015836B2RUM3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AU015836B2RUM3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AU015836B2RUM3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AU015836B2RUM3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AU015836B2RUM3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AU015836B2RUM3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AU015836B2RUM3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AU015836B2RUM3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AU015836B2RUM3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AU015836B2RUM3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AU015836B2RUM3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AU015836B2RUM3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AU015836B2RUM3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AU015836B2RUM3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AU015836B2RUM3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AU015836B2RUM3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AU015836B2RUM3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AU015836B2RUM3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AU015836B2RUM3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AU015836B2RUM3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AU015836B2RUM3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AU015836B2RUM3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AU015836B2RUM3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
AU015836B2RUM3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AU015836B2RUM3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AU015836B2RUM3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AU015836B2RUM3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
AU015836B2RUM3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AU015836B2RUM3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AU015836B2RUM3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AU015836B2RUM3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AU015836B2RUM3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AU015836B2RUM3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AU015836B2RUM3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
AU015836B2RUM3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AU015836B2RUM3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AU015836B2RUM3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AU015836B2RUM3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AU015836B2RUM3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AU015836B2RUM3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AU015836B2RUM3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
AU015836B2RUM3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AU015836B2RUM3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AU015836B2RUM3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AU015836B2RUM3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AU015836B2RUM3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AU015836B2RUM3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AU015836B2RUM3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AU015836B2RUM3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AU015836B2RUM3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AU015836B2RUM3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AU015836B2RUM3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AU015836B2RUM3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AU015836B2RUM3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AU015836B2RUM3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AU015836B2RUM3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AU015836B2RUM3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
AU015836B2RUM3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms