Protein–RNA interactions for Protein: A7XV04

Skint7, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint7A7XV04 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skint7A7XV04 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skint7A7XV04 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skint7A7XV04 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skint7A7XV04 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skint7A7XV04 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skint7A7XV04 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skint7A7XV04 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skint7A7XV04 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Skint7A7XV04 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Skint7A7XV04 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Skint7A7XV04 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Skint7A7XV04 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Skint7A7XV04 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Skint7A7XV04 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Skint7A7XV04 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Skint7A7XV04 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Skint7A7XV04 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Skint7A7XV04 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Skint7A7XV04 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Skint7A7XV04 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Skint7A7XV04 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Skint7A7XV04 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Skint7A7XV04 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Skint7A7XV04 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Skint7A7XV04 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Skint7A7XV04 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skint7A7XV04 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skint7A7XV04 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skint7A7XV04 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skint7A7XV04 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skint7A7XV04 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skint7A7XV04 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Skint7A7XV04 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Skint7A7XV04 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Skint7A7XV04 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Skint7A7XV04 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Skint7A7XV04 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Skint7A7XV04 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skint7A7XV04 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skint7A7XV04 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skint7A7XV04 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skint7A7XV04 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skint7A7XV04 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skint7A7XV04 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skint7A7XV04 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skint7A7XV04 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skint7A7XV04 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skint7A7XV04 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skint7A7XV04 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skint7A7XV04 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skint7A7XV04 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skint7A7XV04 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skint7A7XV04 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skint7A7XV04 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skint7A7XV04 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skint7A7XV04 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skint7A7XV04 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skint7A7XV04 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skint7A7XV04 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Skint7A7XV04 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Skint7A7XV04 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Skint7A7XV04 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Skint7A7XV04 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Skint7A7XV04 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Skint7A7XV04 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Skint7A7XV04 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Skint7A7XV04 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Skint7A7XV04 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skint7A7XV04 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skint7A7XV04 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skint7A7XV04 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skint7A7XV04 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skint7A7XV04 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skint7A7XV04 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skint7A7XV04 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skint7A7XV04 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skint7A7XV04 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skint7A7XV04 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skint7A7XV04 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Skint7A7XV04 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Skint7A7XV04 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Skint7A7XV04 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Skint7A7XV04 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Skint7A7XV04 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Skint7A7XV04 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Skint7A7XV04 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skint7A7XV04 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skint7A7XV04 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skint7A7XV04 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skint7A7XV04 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skint7A7XV04 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skint7A7XV04 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skint7A7XV04 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skint7A7XV04 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skint7A7XV04 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skint7A7XV04 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Skint7A7XV04 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Skint7A7XV04 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Skint7A7XV04 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms