Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CtcflA2APF3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms