Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc183A2AJB1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc183A2AJB1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc183A2AJB1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc183A2AJB1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc183A2AJB1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc183A2AJB1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc183A2AJB1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc183A2AJB1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc183A2AJB1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc183A2AJB1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc183A2AJB1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc183A2AJB1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc183A2AJB1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc183A2AJB1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc183A2AJB1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc183A2AJB1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc183A2AJB1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc183A2AJB1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc183A2AJB1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc183A2AJB1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc183A2AJB1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc183A2AJB1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc183A2AJB1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc183A2AJB1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc183A2AJB1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc183A2AJB1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc183A2AJB1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.6
Ccdc183A2AJB1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc183A2AJB1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc183A2AJB1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc183A2AJB1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc183A2AJB1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc183A2AJB1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc183A2AJB1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc183A2AJB1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc183A2AJB1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc183A2AJB1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc183A2AJB1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc183A2AJB1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc183A2AJB1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc183A2AJB1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc183A2AJB1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc183A2AJB1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc183A2AJB1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc183A2AJB1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc183A2AJB1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc183A2AJB1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc183A2AJB1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc183A2AJB1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc183A2AJB1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc183A2AJB1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc183A2AJB1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc183A2AJB1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc183A2AJB1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc183A2AJB1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc183A2AJB1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc183A2AJB1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc183A2AJB1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc183A2AJB1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc183A2AJB1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc183A2AJB1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc183A2AJB1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc183A2AJB1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc183A2AJB1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc183A2AJB1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc183A2AJB1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc183A2AJB1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc183A2AJB1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms