Protein–RNA interactions for Protein: A2AGX3

Prdm11, PR domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm11A2AGX3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prdm11A2AGX3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prdm11A2AGX3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prdm11A2AGX3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prdm11A2AGX3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Prdm11A2AGX3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prdm11A2AGX3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prdm11A2AGX3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prdm11A2AGX3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prdm11A2AGX3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prdm11A2AGX3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prdm11A2AGX3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prdm11A2AGX3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prdm11A2AGX3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prdm11A2AGX3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prdm11A2AGX3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prdm11A2AGX3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Prdm11A2AGX3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prdm11A2AGX3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prdm11A2AGX3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prdm11A2AGX3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prdm11A2AGX3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prdm11A2AGX3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prdm11A2AGX3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prdm11A2AGX3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prdm11A2AGX3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prdm11A2AGX3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prdm11A2AGX3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prdm11A2AGX3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prdm11A2AGX3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prdm11A2AGX3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prdm11A2AGX3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prdm11A2AGX3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Prdm11A2AGX3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prdm11A2AGX3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prdm11A2AGX3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Prdm11A2AGX3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prdm11A2AGX3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prdm11A2AGX3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prdm11A2AGX3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prdm11A2AGX3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prdm11A2AGX3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prdm11A2AGX3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prdm11A2AGX3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prdm11A2AGX3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prdm11A2AGX3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prdm11A2AGX3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prdm11A2AGX3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prdm11A2AGX3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prdm11A2AGX3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prdm11A2AGX3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prdm11A2AGX3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prdm11A2AGX3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prdm11A2AGX3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Prdm11A2AGX3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prdm11A2AGX3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prdm11A2AGX3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prdm11A2AGX3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Prdm11A2AGX3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prdm11A2AGX3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prdm11A2AGX3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prdm11A2AGX3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prdm11A2AGX3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prdm11A2AGX3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prdm11A2AGX3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Prdm11A2AGX3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prdm11A2AGX3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prdm11A2AGX3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prdm11A2AGX3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prdm11A2AGX3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prdm11A2AGX3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prdm11A2AGX3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prdm11A2AGX3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prdm11A2AGX3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prdm11A2AGX3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prdm11A2AGX3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Prdm11A2AGX3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prdm11A2AGX3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prdm11A2AGX3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prdm11A2AGX3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prdm11A2AGX3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prdm11A2AGX3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prdm11A2AGX3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prdm11A2AGX3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prdm11A2AGX3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prdm11A2AGX3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prdm11A2AGX3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prdm11A2AGX3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prdm11A2AGX3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prdm11A2AGX3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prdm11A2AGX3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prdm11A2AGX3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prdm11A2AGX3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prdm11A2AGX3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prdm11A2AGX3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prdm11A2AGX3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prdm11A2AGX3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prdm11A2AGX3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prdm11A2AGX3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prdm11A2AGX3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms