Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930447F04RikA2AFR2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930447F04RikA2AFR2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930447F04RikA2AFR2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930447F04RikA2AFR2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930447F04RikA2AFR2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4930447F04RikA2AFR2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4930447F04RikA2AFR2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930447F04RikA2AFR2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930447F04RikA2AFR2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930447F04RikA2AFR2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930447F04RikA2AFR2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930447F04RikA2AFR2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
4930447F04RikA2AFR2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4930447F04RikA2AFR2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.04■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.04■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.04■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.04■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.04■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.03■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.02■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.02■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.02■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
4930447F04RikA2AFR2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
4930447F04RikA2AFR2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
4930447F04RikA2AFR2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
4930447F04RikA2AFR2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
4930447F04RikA2AFR2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
4930447F04RikA2AFR2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
4930447F04RikA2AFR2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
4930447F04RikA2AFR2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930447F04RikA2AFR2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
4930447F04RikA2AFR2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930447F04RikA2AFR2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930447F04RikA2AFR2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930447F04RikA2AFR2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930447F04RikA2AFR2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930447F04RikA2AFR2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930447F04RikA2AFR2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930447F04RikA2AFR2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930447F04RikA2AFR2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930447F04RikA2AFR2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930447F04RikA2AFR2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930447F04RikA2AFR2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930447F04RikA2AFR2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930447F04RikA2AFR2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930447F04RikA2AFR2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930447F04RikA2AFR2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930447F04RikA2AFR2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms