Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc173A0JLY1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc173A0JLY1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc173A0JLY1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc173A0JLY1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc173A0JLY1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc173A0JLY1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc173A0JLY1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc173A0JLY1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc173A0JLY1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc173A0JLY1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc173A0JLY1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc173A0JLY1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc173A0JLY1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc173A0JLY1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc173A0JLY1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc173A0JLY1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc173A0JLY1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc173A0JLY1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc173A0JLY1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc173A0JLY1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc173A0JLY1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc173A0JLY1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc173A0JLY1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc173A0JLY1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc173A0JLY1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc173A0JLY1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc173A0JLY1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc173A0JLY1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc173A0JLY1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc173A0JLY1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc173A0JLY1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc173A0JLY1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc173A0JLY1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc173A0JLY1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc173A0JLY1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc173A0JLY1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc173A0JLY1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc173A0JLY1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc173A0JLY1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc173A0JLY1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc173A0JLY1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc173A0JLY1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc173A0JLY1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc173A0JLY1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc173A0JLY1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc173A0JLY1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc173A0JLY1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc173A0JLY1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc173A0JLY1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc173A0JLY1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc173A0JLY1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc173A0JLY1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc173A0JLY1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc173A0JLY1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc173A0JLY1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc173A0JLY1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc173A0JLY1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc173A0JLY1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc173A0JLY1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc173A0JLY1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc173A0JLY1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc173A0JLY1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc173A0JLY1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc173A0JLY1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc173A0JLY1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc173A0JLY1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc173A0JLY1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc173A0JLY1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc173A0JLY1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc173A0JLY1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc173A0JLY1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc173A0JLY1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc173A0JLY1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc173A0JLY1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc173A0JLY1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc173A0JLY1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc173A0JLY1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc173A0JLY1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc173A0JLY1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc173A0JLY1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc173A0JLY1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc173A0JLY1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc173A0JLY1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc173A0JLY1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc173A0JLY1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc173A0JLY1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc173A0JLY1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc173A0JLY1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc173A0JLY1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc173A0JLY1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc173A0JLY1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc173A0JLY1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc173A0JLY1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc173A0JLY1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc173A0JLY1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc173A0JLY1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc173A0JLY1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc173A0JLY1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc173A0JLY1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms