Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
4921501E09RikA0A0R4J054 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.7 ms