Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Krt27Q9Z320 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Krt27Q9Z320 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Krt27Q9Z320 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
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Krt27Q9Z320 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Krt27Q9Z320 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms