Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Hdac6Q9Z2V5 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Hdac6Q9Z2V5 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Hdac6Q9Z2V5 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Hdac6Q9Z2V5 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Hdac6Q9Z2V5 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hdac6Q9Z2V5 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hdac6Q9Z2V5 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hdac6Q9Z2V5 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hdac6Q9Z2V5 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hdac6Q9Z2V5 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hdac6Q9Z2V5 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Hdac6Q9Z2V5 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hdac6Q9Z2V5 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hdac6Q9Z2V5 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hdac6Q9Z2V5 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hdac6Q9Z2V5 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hdac6Q9Z2V5 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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