Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Crlf3Q9Z2L7 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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