Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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