Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP3

Spdef, SAM pointed domain-containing Ets transcription factor, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpdefQ9WTP3 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms