Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PplQ9R269 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PplQ9R269 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PplQ9R269 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PplQ9R269 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Erg-208ENSMUST00000176345 1222 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Gm8226-201ENSMUST00000190511 798 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Gm43726-201ENSMUST00000199110 775 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PplQ9R269 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PplQ9R269 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PplQ9R269 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PplQ9R269 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PplQ9R269 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PplQ9R269 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PplQ9R269 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PplQ9R269 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PplQ9R269 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Gm15636-201ENSMUST00000119205 668 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Gm17207-201ENSMUST00000168686 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PplQ9R269 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms