Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 4930448D08Rik-201ENSMUST00000149958 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm11877-201ENSMUST00000118921 852 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm14417-201ENSMUST00000120036 1074 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm11835-201ENSMUST00000120635 663 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm6182-201ENSMUST00000156439 1208 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 4930486I03Rik-201ENSMUST00000161509 788 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm26609-201ENSMUST00000181302 852 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 4930471M09Rik-201ENSMUST00000181849 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 2610001A08Rik-201ENSMUST00000193315 867 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 4930599N24Rik-201ENSMUST00000198822 1003 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 AC147628.1-201ENSMUST00000228193 688 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Olfr1428-202ENSMUST00000208391 1368 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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