Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM62

Reep6, Receptor expression-enhancing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep6Q9JM62 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Reep6Q9JM62 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms