Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Chrac1Q9JKP8 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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