Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms