Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ush1cQ9ES64 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Ush1cQ9ES64 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Ush1cQ9ES64 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Ush1cQ9ES64 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Ush1cQ9ES64 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Ush1cQ9ES64 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Ush1cQ9ES64 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Ush1cQ9ES64 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Ush1cQ9ES64 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Ush1cQ9ES64 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ush1cQ9ES64 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ush1cQ9ES64 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ush1cQ9ES64 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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