Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCP2

Slc38a3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a3Q9DCP2 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc38a3Q9DCP2 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms